Genes para la resiliencia ante el covid-19: identificación de los marcadores de ADN correspondientes a la resistencia al coronavirus y susceptibilidad

COVID-19 es similar al síndrome respiratorio agudo severo (SARS) en el sentido de que ambos virus infectan a sus huéspedes humanos a través del mismo receptor, el enzima convertidor de angiotensina 2 (receptor ACE2), y causan características clínicas y patológicas similares. Curiosamente, la proteína espiga, que es responsable de la unión al receptor, es muy similar entre 2019-nCoV y SARS-CoV, lo que se debe a una selección significativa para el mismo receptor (Wu., 2020). La investigación sobre cómo nuestros cuerpos se defienden contra el SARS podría revelar cómo nuestros cuerpos podrían defenderse contra el covid-19. Varios estudios de asociación genómica amplia (GWAS) recientes han proporcionado una comprensión mucho más profunda de las variaciones genéticas que pueden ayudar a explicar por qué algunas personas prácticamente no se ven afectadas por COVID-19, y para otros el virus es una amenaza para la vida o incluso fatal.

En esta publicación, proporcionamos una revisión de la literatura revisada por pares y presente información sobre genes candidatos para Resistencia al SARS-CoV. Si te has hecho una prueba de ADN casera como los disponibles de 23andMe, Ancestry ADN, laboratorios Dante, puede evaluar sus datos de ADN sin procesar y ver cómo se compara su secuencia de ADN con la resultados de la investigación.

Cómo analizar su ADN para detectar resistencia o susceptibilidad al coronavirus?

Paso 1) Descargue su archivo de ADN autosómico crudo y guárdelo en un lugar seguro y seguro

Para analizar sus datos de ADN, comience descargando su ADN crudo y guardándolo en un lugar seguro. Aquí hay instrucciones para descargar su archivo de ADN crudo de: 23andMe, Ancestry DNA, Family Tree DNA, Dante Labs, My Heritage, Genes For Good, Vitagene, and Living DNA.

Paso 2) Analice su archivo de ADN sin procesar

Busque sus datos de ADN crudo usando un editor de texto como "text wrangler" o "bloc de notas" usando la función "buscar" o usando la línea de comandos.

Abra su archivo de ADN crudo y notará los encabezados de SNP ID (rs# o i#) únicos, cromosoma, posición y genotipo. Los formatos difieren ligeramente entre cada empresa de pruebas de ADN directo al consumidor.

Para evaluar su riesgo de una mala recuperación de la COVID-19, busque estos marcadores de ADN descritos a continuación:

Recientemente se publicaron varios estudios de asociación genómica (GWAS) que describen loci asociados con la falla respiratoria en pacientes infectados con SARS-CoV-2 y tres estudios identificaron marcadores SNP en el mismo segmento genómico de ~50 kb que se hereda de los neandertales. (Ellinghaus D et al., 2020, Zeberg & Pääbo, and Blokland et al., 2020). Además, estos estudios GWAS también identificaron una serie de otros ADNmarcadores que están asociados con COVID-19, y cada de estos se presentan en la siguiente tabla.

Además, otros marcadores de ADN cubiertos en esta publicación incluyen rs4804803, que se asoció con SARS, y aquellos ubicados en el receptor de la enzima convertidora de angiotensina-2 (ACE2), que se demostró que era el mismo receptor para el coronavirus respiratorio humano NL63, el coronavirus SARS (SARS-CoV) y el nuevo coronavirus 2019-nCoV / SARS-CoV (Li et al., 2017; Lu et al., 2019). Dado que la proteína de espiga del coronavirus ha evolucionado para adaptarse al receptor ACE2, es probable que los individuos con variaciones que alteran la secuencia de proteínas presenten un grado de resistencia al covid-19. A continuación se muestran los SNPs no sinónimos del transcripto ACE2 NM_021804.2 y, en particular, los SNPs que causan cambios importantes como rs199951323, que resulta en un codón de parada prematuro.